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有区别，而且在操作方法、样品制备、成像效果等方面差别不小。

1. 导电性差异

金属：天然导电，电子束轰击后电荷容易流走，不会产生明显充电效应，成像稳定。

非金属（绝缘体）：电子束轰击时电荷会在表面积累（充电），导致图像发亮、漂移甚至失真，需要采取额外措施（如镀膜或低真空模式）。

2. 样品制备

金属：通常不需要额外导电处理，只需清洁、固定即可。

非金属：

镀导电膜（如金、铂、碳）

低真空/环境 SEM 模式（用气体中和电荷）

降低加速电压（减少充电）

3. 成像模式

金属可使用高加速电压（10–30 kV）获得高分辨率图像。

非金属常用低电压（1–5 kV）减少充电，同时可能需要使用背散射电子（BSE）或低真空模式提高图像质量。

4. 元素分析（EDS/EDX）影响

金属样品的 EDS 光谱背景噪声低，峰值清晰。

非金属样品如果镀膜，会引入额外元素（如 Au、Pt、C），影响分析结果，需要在解释数据时考虑。